郭颖婕

guo.png郭颖婕(副教授)

研究领域:生物信息学,机器学习,数据挖掘

电子邮箱:yjguo@sxu.edu.cn

个人简介:

      博士,副教授,硕士生导师, 2019年毕业于哈尔滨工业大学计算机学院获得博士学位。博士期间于2014-2016年赴美国康奈尔大学生物统计与计算生物学系进行联合培养。博士毕业后加入电子科技大学基础与前言研究院从事博士后研究工作,并于2021年12月入职山西大学。近年来,在《Science China Life Sciences》、《Frontiers in Cell and Developmental Biology》、《计算机研究与发展》等国内外重要期刊发表论文10余篇,主持1项国家自然基金青年基金项目,1项省基金,参与多项国家级项目。

教育教学:

本科专业必修课《数据结构》

本科专业必修课《大数据行业应用案例》

本科专业必修课《大数据技术开源架构》

招生信息:

欢迎报考课题组硕士研究生,本人招收计算机科学与技术专业学术型硕士与专业型硕士。课题组科研氛围浓厚、软硬件支撑完备,将根据每位同学实际情况制定对应的培养方案,从理论研究和工程实践两方面不断提升个人科研能力。要求:学习态度端正、主动积极,对利用人工智能、机器学习等先进算法从事生物信息学相关课题感兴趣,具备一定的代码能力。

同时欢迎本科生加入课题组开展基础科研工作。

科研项目情况:

[1] 基于单细胞转录组数据的乳腺癌瘤内异质性分析及其转移机制研究, 山西省回国留学人员科研资助项目,2023-2026,课题编号:2023-006。主持

[2] 基于GWAS与eQTL数据整合的复杂疾病易感基因定位及其功能分析,国家自然科学基金青年科学基金项目。2021-2023,课题编号:62002243。 主持

[3] 基于全基因组关联分析的遗传调控网络构建算法研究,国家自然科学基因重大研究计划项目。2014-2016。课题编号:91335112。参加

[4] 基于网络模型的癌症相关模式挖掘理论与方法,国家自然科学基金重点项目。2016-2020。课题编号:61532014。参加

[5] 精准医学文本知识发现与呈现,国家重点研发计划子课题。2016-2020。课题编号:2016YFC0901902。参加

学术成果:

[1] Guo, Y., Wu, C., Yuan, Z., Wang, Y., Liang, Z., Wang, Y., Zhang, Y. and Xu, L., 2021. Gene-based testing of interactions using XGBoost in genome-wide association studies. Front Cell Dev Biol, doi:10.3389/fcell.2021.801113.

[2] Guo, Y., Cheng, H., Yuan, Z., Liang, Z., Wang, Y. and Du, D., 2021. Testing Gene-Gene Interactions Based on a Neighborhood Perspective in Genome-wide Association Studies. Front Genet,doi:10.3389/fene.2021.801261.

[3] Guo, Y., Yuan, Z., Liang, Z., Wang, Y., Wang Y., Xu, L., 2022, Maximal Information Coefficient-Based Testing to Identify Epistasis in Case-Control Association Studies. Comput Math Methods Med, doi:10.1155/2022/7843990

[4] Guo, Y., Wu, C., Guo, M., Zou, Q., Liu, X. and Keinan, A., 2019. Combining sparse group lasso and linear mixed model improves power to detect genetic variants underlying quantitative traits. Front Genet, doi:10.3389/fgene.2019.00271. eCollection 2019.

[5] Guo, Y., Wu, C., Guo, M., Liu, X. and Keinan, A., 2018. Gene-based nonparametric testing of interactions using distance correlation coefficient in case-control association studies. Genes, doi:10.3390/genes9120608.

[6] 郭颖婕, 刘晓燕, 吴辰熙,郭茂祖,李傲。基于U统计量和集成学习的基因互作检测方法. 计算机研究与发展[J]。2018,55(8):1683-1693.

[7] 郭颖婕,刘晓燕,郭茂祖,邹权. 植物抗性基因识别中的随机森林分类方法[J]. 计算机科学与探索,2012,6(1):67-77.

[8] 郭颖婕,李傲,刘晓燕,郭茂祖. 基于XGBOOST的质量性状基因互作检测方法[J]. 智能计算机与应用,2020,10(3):202-208.

[9] Cheng, H., Qian, Y., Guo, Y., Zheng, K., Zhang, Q., 2022. Neighborhood Information-based Method for Multivariate Association Mining. IEEE T KNOWL DATA EN, doi:10.1109/TKDE.2022.3178090.

[10] Liang, Z., Wu, Y., Guo, Y., Liu, Y., Ma, L. and Wu, Y., 2021. Bi-functional selection markers assist segregation of transgene-free, genome-edited mutants. Sci China Life Sci, 64(9), doi:10.1007/s11427-020-1820-9.

[11] Liang, Z., Wu, Y., Ma, L., Guo, Y., and Ran, Y., 2021. Efficient Genome Editing in Setaria italica Using CRISPR/Cas9 and Base Editors. Front. Plant Sci., doi: 10.3389/fpls.2021.815946.

[12] Wang, Y.,Wang, P.,Guo, Y.,Huang, S.,Chen, Y. and Xu, L., 2020. prPred: A Predictor to Identify Plant Resistance Proteins by Incorporating K-Spaced Amino Acid(Group) Pairs. Front Bioeng Biotechnol, doi:10.3389/fbioe.2020.645520.

[13] Gao, F., Chang, D., Biddanda, A., Ma, L., Guo, Y., Zhou, Z. and Keinan, A., 2015. XWAS: a software toolset for genetic data analysis and association studies of the X chromosome. J Hered, doi:10.1093/jhered/esv059.